近日，云南大学云南生物资源保护与利用国家重点实验室张志刚研究员团队联合复旦大学附属上海市公共卫生临床中心张驰宇教授团队和复旦大学附属儿科医院徐锦研究员团队，首次研究揭示了儿童感染COVID-19后上呼吸道和肠道菌群持续的扰动和失衡。研究论文题为“Progressive deterioration of the upper respiratory tract and the gut microbiomes in children during the early infection stages of COVID-19”，于5月29日在Journal of Genetics and Genomics (JGG)发表 (https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.05.004 )。这是该团队继解析COVID-19成年患者病程中上呼吸道和肠道菌群变化之间的时间相关性后（文章在2021年2月18日发表于Communications Biology https://doi.org/10.1038/s42003-021-01796-w），在此领域的新成果。

菌群，特别是肠道菌群，与人类健康密切相关。人体早期菌群的形成和发育对儿童期和成人后的健康起到关键作用。大量研究表明，病毒感染可导致机体肠道菌群失衡，进而加剧疾病进程或延缓康复。新冠病毒（SARS-CoV-2）可以感染包括呼吸道、肺、肠道等在内的多个组织器官，且多项研究显示COVID-19改变和影响成人的肠道和呼吸道菌群。与成人相比，儿童对SARS-CoV-2相对不易感。在新冠肺炎成人患者的上呼吸道和肠道菌群从早期失衡向后期多样化状态同步恢复的研究背景下，感染SARS-CoV-2是否以及如何影响儿童的菌群尚不清楚。

该研究针对9个新冠感染儿童的上呼吸道和肠道菌群动态演化进行了持续近2个月的观测和分析，包括病程急性、中期和恢复期，结果发现：1. SARS-CoV-2感染改变了儿童上呼吸道和肠道的菌群结构；2. 儿童在新冠感染后的2个月内菌群持续失衡且极具波动，甚至延续到康复出院后的2–3周；3. 感染儿童的上呼吸道和肠道菌群展现不同步的动态演化趋势。上呼吸道和肠道菌群协调恢复在新冠病毒感染的儿童和成人间存在明显差别，儿童的菌群相对脆弱，易受干扰。新冠病毒对儿童上呼吸道和肠道菌群发育的长期影响及其带来的潜在健康风险值得持续关注。

成果总结：儿童和成人感染COVID-19期间上呼吸道和肠道菌群的演化

硕士生许蓉、助理柳鹏程、博士生张涛和助理吴群富为该论文的共同第一作者，张驰宇教授、张志刚研究员和徐锦研究员为该论文的共同通讯作者。该工作得到了国家重点研发计划(2018YFC2000500,2017ZX10103009-002), 第二次青藏高原综合科学考察研究项目(2019QZKK0503), 中国科学院重点资助项目(FZDSW-219), 国家自然科学基金(31970571)以及复旦大学附属儿科医院2019冠状病毒肺炎专项资助(EKXGZX006)的支持。

　　供稿：云南生物资源保护与利用国家重点实验室

　　编辑：李哲

责任编辑：曾文蕊