溶酶体是细胞降解循环生物大分子物质的重要细胞器。它接收来自包括吞噬等多种囊泡运输途径转运的货物。降解后,氨基酸、糖、核苷酸等生物大分子经由溶酶体膜上转运蛋白运送至胞质中,供细胞再利用。而溶酶体需要经历再形成的过程维持其正常的稳态平衡。
近期,细胞生物学著名期刊The Journal of Cell Biology (JCB) 2019年第8期发表了云南大学生命科学中心生命科学学院杨崇林教授实验室的研究论文,题目是The amino acid transporter SLC-36.1 cooperates with PtdIns3P 5-kinase to control phagocytic lysosome reformation。该项研究结果以Article形式在线发表,并被选为封面文章。
JCB封面:吞噬溶酶体再形成的电镜图片
在微分干涉显微镜下,线虫胚胎细胞发生凋亡后呈现出特殊的纽扣状突起形态。杨崇林实验室通过正向遗传学筛选,获得了多个凋亡细胞呈凹坑状的突变体,经克隆发现是由于slc-36.1基因功能缺失突变导致。SLC-36.1蛋白在人类中的同源物是中性氨基酸转运蛋白SLC-36A1。SLC-36.1定位在细胞质膜和溶酶体膜上,而且它的氨基酸转运活性对于其功能是必须的。研究者用绿色荧光蛋白标记溶酶体膜蛋白LAAT-1,用红色荧光蛋白标记溶酶体基质蛋白NUC-1,在荧光显微镜追踪溶酶体在生理条件下的变化过程。在野生型线虫的胚胎中,随着吞噬溶酶体不断伸出丝状结构,并显示有新的溶酶体产生,而吞噬溶酶体的体积不断缩小并最终消失。但是,在slc-36.1突变体的胚胎中,吞噬溶酶体出丝的次数明显减少,并且吞噬溶酶体的体积在很长时间内都保持不变(下图)。因此,SLC-36.1对于溶酶体从吞噬溶酶体上再形成的过程是必需的。
SLC-36.1为溶酶体从吞噬溶酶体上再形成所必需
该研究还发现PPK-3功能缺失同样会阻碍溶酶体从吞噬溶酶体上再形成。PPK-3是磷脂酰肌醇-3-磷酸激酶,能够催化磷脂酰肌醇-3-磷酸继续磷酸化,生成磷脂酰肌醇-3,5-二磷酸,已知磷脂酰肌醇-3,5-二磷酸对于膜分裂起着重要作用。进一步的研究表明,SLC-36.1直接与PPK-3相互作用,形成复合体,协同作用发挥调控作用。研究还发现,在溶酶体从自噬溶酶体上再形成的过程中,SLC-36.1-PPK-3复合物也发挥了调控作用。
SLC-36.1-PPK-3复合物调控溶酶体再形成的模式图
综上所述,本项研究提供的实验证据指明了SLC-36.1-PPK-3复合物在吞噬溶酶体/自噬溶酶体的溶酶体再形成过程中起到了至关重要的调控作用。
云南生物资源保护与利用国家重点实验室、云南大学生命科学中心及生命科学学院为本研究的第一单位。实验室甘启文博士为本文第一作者,国家杰出青年基金获得者杨崇林教授为通讯作者。
华中科技大学同济医学院国家杰青史岸冰教授点评认为:杨崇林教授实验室以秀丽线虫为模式体系,经过长期的积累、总结和发展,深入解析了一系列晚期内体和溶酶体形成、吞噬溶酶体再生以及相关疾病的调控机制,在Science、Nat Cell Biol、J Cell Biol、Mol Psychiatry等知名学术期刊上发表了大量重要成果。杨崇林实验室在本期JCB发表的工作中,充分利用细胞生物学、遗传学和生物化学手段,通过大量实验证据揭示了此前未被发现的PIKfyve调控溶酶体重生的新机制,展示了SLC-36.1能够直接与PPK-3/PIKfyve相互作用形成复合体,促进氨基酸外运和溶酶体膜出丝,维持溶酶体动态,在溶酶体从自噬溶酶体再生过程中协同发挥调控作用,为进一步理解磷脂酰肌醇代谢酶在溶酶体再生中的功能意义提供了重要的科学证据。此外,该工作还为后续溶酶体相关生理和病理机制研究提供了新的理论线索,例如在组织发育、衰老过程中,mTOR活化及自噬介导吞噬清除凋亡细胞,PPK-3/PIKfyve在其中可能起到关键作用。
科学技术处 生命科学中心供稿
(编辑:李哲)